水いぼの治療に用いられる薬は、その効果が期待される一方で、副作用が現れる可能性もゼロではありません。どのような薬であっても、体質や使用方法によっては意図しない反応が起こり得るため、事前に副作用について理解しておくことは非常に大切です。皮膚科で処方される水いぼ治療薬の中で、例えばサリチル酸を含む外用薬やスピール膏のようなものは、角質を軟化させたり剥離させたりする作用がありますが、これにより周囲の健康な皮膚に炎症やかぶれ、ただれを引き起こすことがあります。また、硝酸銀ペーストなど化学的に組織を変化させるタイプの薬では、塗布時に痛みを感じたり、皮膚が黒ずんだりすることが報告されています。液体窒素による冷凍療法も薬物療法とは異なりますが、治療の一環としてよく行われ、治療後に水ぶくれや色素沈着が起こることが一般的です。市販薬の場合、例えばヨクイニンを主成分とする内服薬は、比較的副作用が少ないとされていますが、稀に胃腸症状（食欲不振、胃部不快感、下痢など）や発疹が現れることがあります。外用の市販薬に関しても、配合されている成分によっては、接触皮膚炎（かぶれ）を起こすリスクがあります。特に、アレルギー体質の方や敏感肌の方は注意が必要です。薬を使用していて、塗布した部分に強い赤み、かゆみ、痛み、腫れ、水ぶくれなどが見られた場合、あるいは内服薬で体調に異変を感じた場合は、自己判断で薬の使用を継続せず、速やかに使用を中止し、処方した医師または薬剤師に相談することが重要です。副作用が疑われる症状が出た際に、どの程度の症状であれば様子を見るべきか、いつ医療機関を受診すべきかの判断は難しいものです。そのため、薬を受け取る際には、あらかじめ起こりうる副作用について詳しい説明を受け、緊急時の連絡先や対処法を確認しておくと安心です。医師は副作用のリスクと治療効果を天秤にかけ、患者にとって最善と判断した薬を処方しています。しかし、万が一の事態に備え、正しい知識を持つことが、安全な治療を進める上で不可欠と言えるでしょう。